1.有機農產品在生產加工過程中禁止使用農藥、化肥、激素等人工合成物質，并且不允許使用基因工程技術;其他農產品則允許有限使用這些物質，并且不禁止使用基因工程技術。

2.有機農產品在土地生產轉型方面有嚴格規定。考慮到某些物質在環境中會殘留相當一段時間，土地從生產其他農產品到生產有機農產品需要2~3年的轉換期，而生產綠色農產品和無公害農產品則沒有土地轉換期的要求。

3.有機農產品在數量上須進行嚴格控制，要求定地塊、定產量，其他農產品沒有如此嚴格的要求。